Kontaktperson

Dagfinn Arntzen
Tlf. direkte: 922 86 478 dagfinn.arntzen@nmas.no

Sekvensering og fragmentanalyse


Sekvensinstrumentet CEQ 8800 fra Beckman Coulter øker produktiviteten av DNA-analyser vesentlig. CEQ 8000/8800 er et fleksibelt DNA instrument med 8 kapillær som utfører sekvens- og fragmentanalyse med høy grad av nøyaktighet.

CEQ 8000/8800 er automatisert slik at operatør trenger kun 5-10 minutter på å sette opp instrumentet. Instrumentet kan kjøre sekvens og fragment fra samme prøveplate. Intrumentene har lave driftskostnader.

Sekvensér opp til 900 bp på 8 prøver på under 90 min. og 500 bp på 8 prøver på 45 min. Instrumentene kan separere fra 70 bp til 700 bp med en oppløsning på +/- 1 base inntil 400 bp og +/-2 baser opp til 700 bp.
 
Fragment oppløsningen er:
  • +1 base ved 400 baser
  • +2 baser ved 600 baser
Sekvensering
  • Her anvendes dye-labeled dideoxy-terminator cycle sequencing (DTCS) kjemi. WellRED dyes fluorescerer i det røde spektrum, hvor naturlig bakgrunn er meget lav,  dette er med på å gi optimale sekvensresultater.
  • Spesiell CEQ separationsgel, som sikrer høy oppløselighet. Gelen er pakket i en sprøyte og rekker til 96 kjøringer
  • Kapillarer er lette å skifte og holder til mer enn 100 kjøringer eller til mer enn 800 prøver.
  • Samme mikroplate kan brukes til termocyling og prøvepåsetting på CEQ.
  • Automatisk denaturering av prøver umiddelbart før påsetting på CEQ reduserer sekundære strukturartifakter (artifakter - forstyrrelser).

Brukervennlig Windows-basert programvare med bl.a. heterozygotdetektion, confirmatory sequencing og SNP-analyse. Det er kompatibelt med en lang rekke andre analyseprogramvare, blant annet VectorNTI og Sequencher. Data kan eksporteres automatisk, så snart en rekke data er ferdigkjørt.

 
Fragmentanalyse
CEQ 8000 til fragmentanalyse bruker samme gel og buffer som til sekvensering, men fordi kapillærene er kortere er separasjonstiden raskere .
  • CEQ 8000 kan separere fra 70 bp til 600 bp med en oppløsning på +/-1 base inntil 400 bp og +/-2 baser opp til 600 bp
  • Det tar kun 45 min. å separere opp til 350 baser på 8 prøver og ca. 9 timer på 96 prøver - med 15 markører gir det 1.440 markører på 9 timer
  • 4 farger tilgjengelige på hver kapillær - hvor den ene brukes til intern standard. Opp til 5 markører på de tre andre fargene, noe som gir totalt 15 primersett pr kapillær
  • Meget enkelt å skifte mellom sekvenserings- og fragmentanalysemetoden
  • AFLP software.

 

 

Kontakt meg

Fyll ut kontaktinfo og hva det gjelder hvis du ønsker at vi skal ta kontakt.

Bedrift

Telefon

E-post

Fritekst

Nerliens Meszansky AS

Postboks 158 Økern, 0509 Oslo - Økernveien 121, 0579 Oslo - +47 22 66 65 00